金魚的體色有單一色和混雜色兩大類。單色有紅、橙、紫、黃、白、藍、黑等；混雜色有兩種或兩種以上顏色構成的彩色十多種。這些顏色的形成與其生存的環境和所食餌料的成分有關，在不同的飼養管理和環境下，金魚鱗片中所含黑色素體、黃色素體和淡蘭色反光質三者就會有數量上的變化。橙紅色金魚缺少黑色素體：墨色金魚的黑色素體和黃色素體濃密；白色金魚則沒有黑色素體和黃色素體；紫色金魚的黃色素體濃密而黑色素體稀疏；藍色金魚缺少黃色素體；紫藍色金魚無黑色素體，而黃色素體和淡藍色反光質發育旺盛；雜斑或五花金魚則是由這三種色素體依不同數量、比例相混而組成各種花的的圖案。