首先并不是波斯貓的眼睛都是鴛鴦眼，鴛鴦眼的波斯貓多半是白毛，而且，重要的是，鴛鴦眼的貓多半是雜種！（因為基因突變的概率很小，也可以說都是雜種） 而且不是只有波斯貓有鴛鴦眼，其他貓也有。
    純種貓的兩只眼睛顏色是一樣的，鴛鴦眼一般認為是雜種所致。這種貓（中國臨清貓或土耳其安卡拉貓）多數有遺傳缺陷，藍眼睛非常漂亮，耳朵卻是聾的。所以人們用黃眼睛白貓跟這種貓雜交，繁育出鴛鴦眼，一只黃、一只藍眼睛的白色長毛貓，就沒有耳聾的缺陷了。
    波斯貓眼色因毛色而定，一般認為波斯貓眼睛的顏色有藍色、綠色、紫銅色、金色、琥珀色、怪色和兩只眼睛具有不同顏色(即鴛鴦眼)。鴛鴦眼波斯貓的毛色常為白色。綠色、琥珀色及金色眼睛的貓，一般屬于銀灰毛色系。各種眼睛的顏色越純、越深越好，并且以兩只眼睛的顏色均勻為佳。